Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EGFRP00533 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EGFRP00533 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EGFRP00533 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EGFRP00533 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EGFRP00533 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EGFRP00533 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms