Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

Predictions only

Length 4,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC2O95714 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC2O95714 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC2O95714 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC2O95714 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC2O95714 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC2O95714 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC2O95714 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC2O95714 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC2O95714 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC2O95714 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC2O95714 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC2O95714 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC2O95714 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERC2O95714 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERC2O95714 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERC2O95714 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERC2O95714 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERC2O95714 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
HERC2O95714 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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