Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP10AO60312 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATP10AO60312 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP10AO60312 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms