Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms