Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNMO15061 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNMO15061 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNMO15061 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNMO15061 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNMO15061 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNMO15061 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNMO15061 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNMO15061 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNMO15061 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNMO15061 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNMO15061 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNMO15061 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNMO15061 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNMO15061 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNMO15061 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNMO15061 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNMO15061 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNMO15061 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNMO15061 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNMO15061 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNMO15061 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNMO15061 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNMO15061 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNMO15061 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNMO15061 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNMO15061 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNMO15061 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNMO15061 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNMO15061 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNMO15061 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNMO15061 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNMO15061 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNMO15061 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYNMO15061 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNMO15061 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNMO15061 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNMO15061 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNMO15061 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNMO15061 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNMO15061 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNMO15061 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNMO15061 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNMO15061 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNMO15061 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNMO15061 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNMO15061 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNMO15061 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNMO15061 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SYNMO15061 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNMO15061 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms