Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CUX2O14529 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CUX2O14529 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CUX2O14529 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CUX2O14529 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CUX2O14529 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CUX2O14529 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CUX2O14529 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CUX2O14529 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CUX2O14529 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CUX2O14529 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CUX2O14529 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CUX2O14529 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CUX2O14529 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CUX2O14529 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CUX2O14529 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CUX2O14529 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CUX2O14529 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CUX2O14529 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CUX2O14529 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CUX2O14529 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CUX2O14529 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CUX2O14529 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CUX2O14529 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CUX2O14529 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CUX2O14529 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CUX2O14529 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CUX2O14529 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
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