Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAF5O00463 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF5O00463 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms