Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SPOCK3Q9BQ16 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SPOCK3Q9BQ16 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 310.1 ms