Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

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Length 813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNX29Q8TEQ0 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SNX29Q8TEQ0 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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SNX29Q8TEQ0 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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SNX29Q8TEQ0 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SNX29Q8TEQ0 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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