Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
MSMPQ1L6U9 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.7 ms