Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC3□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
E2F4Q16254 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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