Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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TWIST1Q15672 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
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TWIST1Q15672 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TWIST1Q15672 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
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TWIST1Q15672 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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TWIST1Q15672 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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TWIST1Q15672 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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TWIST1Q15672 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
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TWIST1Q15672 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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TWIST1Q15672 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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TWIST1Q15672 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
TWIST1Q15672 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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