Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TRIP4Q15650 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TRIP4Q15650 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIP4Q15650 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIP4Q15650 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIP4Q15650 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIP4Q15650 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIP4Q15650 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIP4Q15650 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TRIP4Q15650 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms