Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FHL3Q13643 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FHL3Q13643 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.7 ms