Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1H3Q13133 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1H3Q13133 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1H3Q13133 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1H3Q13133 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1H3Q13133 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NR1H3Q13133 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NR1H3Q13133 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NR1H3Q13133 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NR1H3Q13133 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NR1H3Q13133 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NR1H3Q13133 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NR1H3Q13133 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NR1H3Q13133 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NR1H3Q13133 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NR1H3Q13133 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NR1H3Q13133 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NR1H3Q13133 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NR1H3Q13133 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1H3Q13133 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1H3Q13133 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1H3Q13133 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1H3Q13133 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1H3Q13133 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1H3Q13133 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1H3Q13133 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1H3Q13133 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NR1H3Q13133 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NR1H3Q13133 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1H3Q13133 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1H3Q13133 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1H3Q13133 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1H3Q13133 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1H3Q13133 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NR1H3Q13133 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1H3Q13133 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1H3Q13133 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1H3Q13133 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1H3Q13133 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1H3Q13133 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1H3Q13133 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NR1H3Q13133 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NR1H3Q13133 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
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