Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
FAM53CQ9NYF3 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM53CQ9NYF3 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM53CQ9NYF3 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM53CQ9NYF3 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM53CQ9NYF3 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM53CQ9NYF3 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM53CQ9NYF3 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM53CQ9NYF3 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM53CQ9NYF3 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM53CQ9NYF3 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM53CQ9NYF3 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FAM53CQ9NYF3 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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