Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXQ1Q9C009 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXQ1Q9C009 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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