Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
DDX54Q8TDD1 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
DDX54Q8TDD1 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
DDX54Q8TDD1 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms