Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CNGA3Q16281 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183 ms