Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
E2F4Q16254 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
E2F4Q16254 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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