Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PKP1Q13835 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PKP1Q13835 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PKP1Q13835 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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