Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRAF3Q13114 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
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TRAF3Q13114 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAF3Q13114 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAF3Q13114 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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