| FLII | Q13045 | OR2L2-202 | ENST00000641771 | 4300 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | PYGO1-201 | ENST00000302000 | 8488 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP160-201 | ENST00000364866 | 120 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | AC019129.1-201 | ENST00000403786 | 261 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | RPL39P34-201 | ENST00000477141 | 156 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | AC008834.1-201 | ENST00000511612 | 175 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | TAB2-205 | ENST00000538427 | 4240 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | MIR5089-201 | ENST00000580047 | 84 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | uc_338.28-201 | ENST00000612082 | 187 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | MIR8065-201 | ENST00000620577 | 100 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | ZNF355P-201 | ENST00000427301 | 3216 nt | BASIC | 2.55 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.309-201 | ENST00000365046 | 111 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | MIR1289-2-201 | ENST00000408360 | 111 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | AC027119.1-201 | ENST00000440877 | 241 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | AC087741.2-201 | ENST00000619415 | 172 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | TBL1XR1-208 | ENST00000430069 | 7948 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | MIER3-204 | ENST00000381226 | 5210 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | ZDBF2-202 | ENST00000611847 | 9890 nt | TSL 5 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-396P-201 | ENST00000365369 | 105 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
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| FLII | Q13045 | RNU6ATAC38P-201 | ENST00000408119 | 126 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| FLII | Q13045 | AL365434.1-201 | ENST00000412362 | 380 nt | TSL 3 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
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| FLII | Q13045 | RNU6-1237P-201 | ENST00000384777 | 107 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
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| FLII | Q13045 | AC068339.1-201 | ENST00000526965 | 141 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1014P-201 | ENST00000383940 | 103 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.507-201 | ENST00000384500 | 99 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
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| FLII | Q13045 | RNU6-816P-201 | ENST00000390914 | 107 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
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| FLII | Q13045 | PRELID3BP2-201 | ENST00000605362 | 201 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | AL162726.3-218 | ENST00000636401 | 95 nt | BASIC | 2.51 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | CTDSPL2-202 | ENST00000558373 | 4255 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | U8.6-201 | ENST00000364939 | 135 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP445-201 | ENST00000515889 | 115 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | MIR5009-201 | ENST00000578736 | 100 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | SPTSSB-205 | ENST00000620149 | 231 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | SI-201 | ENST00000264382 | 6011 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | MIR103A2-201 | ENST00000362154 | 78 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.163-201 | ENST00000363702 | 113 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | RNU1-78P-201 | ENST00000391248 | 165 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | MIR1912-201 | ENST00000410389 | 80 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP237-201 | ENST00000410414 | 113 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | AL512310.8-201 | ENST00000550183 | 120 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | MIR3618-201 | ENST00000580330 | 88 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | HFM1-201 | ENST00000370425 | 4931 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | MIR450A1-201 | ENST00000362262 | 91 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-19-201 | ENST00000363098 | 82 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-18-201 | ENST00000363293 | 82 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.155-201 | ENST00000363632 | 101 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-17-201 | ENST00000364612 | 82 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-106P-201 | ENST00000384405 | 107 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1086P-201 | ENST00000410930 | 100 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | AL135923.1-201 | ENST00000413066 | 196 nt | TSL 3 BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
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| FLII | Q13045 | AP000753.3-201 | ENST00000604083 | 169 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.773-201 | ENST00000607168 | 90 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | OXR1-209 | ENST00000517566 | 4501 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.323-201 | ENST00000365157 | 109 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-147P-201 | ENST00000383983 | 107 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-616P-201 | ENST00000384353 | 107 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | TRAJ47-201 | ENST00000390490 | 57 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | U8.13-201 | ENST00000390842 | 128 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-554P-201 | ENST00000410466 | 106 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | MIR2115-201 | ENST00000516657 | 100 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | AP000942.3-201 | ENST00000603702 | 160 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | MIR1255B1-201 | ENST00000636325 | 63 nt | BASIC | 2.47 | □□□□□ -2.01 | | |
| FLII | Q13045 | snoU13.25-201 | ENST00000458945 | 104 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | RN7SL274P-201 | ENST00000492268 | 272 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6ATAC12P-201 | ENST00000516542 | 115 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | RN7SKP88-201 | ENST00000516847 | 250 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | FAM71BP1-201 | ENST00000604431 | 523 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | 7SK.8-201 | ENST00000612110 | 250 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | 7SK.11-201 | ENST00000615477 | 250 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | 7SK.13-201 | ENST00000622040 | 250 nt | BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | GNPDA2-204 | ENST00000509756 | 5382 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.46 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP264-201 | ENST00000363115 | 107 nt | BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | AC024382.1-201 | ENST00000520224 | 292 nt | TSL 3 BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | CERS6-AS1-202 | ENST00000594898 | 499 nt | TSL 5 BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-94P-201 | ENST00000607728 | 107 nt | BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | OR5M1-202 | ENST00000641076 | 4302 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | UBE3A-225 | ENST00000636667 | 5726 nt | TSL 5 BASIC | 2.45 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | AC008781.2-201 | ENST00000502205 | 2480 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.44 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | PTPRQ-209 | ENST00000616559 | 8165 nt | TSL 5 BASIC | 2.44 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | RNU4-67P-201 | ENST00000364569 | 141 nt | BASIC | 2.44 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA51.5-201 | ENST00000384126 | 131 nt | BASIC | 2.44 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | MIR934-201 | ENST00000401241 | 83 nt | BASIC | 2.44 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | MIR1302-7-201 | ENST00000408841 | 72 nt | BASIC | 2.44 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP338-201 | ENST00000410495 | 85 nt | BASIC | 2.44 | □□□□□ -2.02 | | |
| FLII | Q13045 | AC245517.4-201 | ENST00000448601 | 281 nt | BASIC | 2.44 | □□□□□ -2.02 | | |