Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CHRNEQ04844 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNEQ04844 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.9 ms