Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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PGGT1BP53609 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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PGGT1BP53609 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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PGGT1BP53609 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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PGGT1BP53609 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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PGGT1BP53609 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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PGGT1BP53609 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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PGGT1BP53609 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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PGGT1BP53609 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PGGT1BP53609 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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