Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF548Q8NEK5 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF548Q8NEK5 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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