Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
DUSP6Q16828 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DUSP6Q16828 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms