Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL19A1Q14993 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL19A1Q14993 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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