Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCARF1Q14162 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARF1Q14162 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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