Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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SNTA1Q13424 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SNTA1Q13424 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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SNTA1Q13424 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNTA1Q13424 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNTA1Q13424 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNTA1Q13424 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SNTA1Q13424 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNTA1Q13424 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNTA1Q13424 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNTA1Q13424 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNTA1Q13424 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNTA1Q13424 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNTA1Q13424 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNTA1Q13424 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNTA1Q13424 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SNTA1Q13424 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
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