Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTGDRQ13258 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
PTGDRQ13258 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms