Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
TRIM32Q13049 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRIM32Q13049 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TRIM32Q13049 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRIM32Q13049 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms