Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATG3Q9NT62 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ATG3Q9NT62 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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