Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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RTN1Q16799 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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RTN1Q16799 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RTN1Q16799 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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RTN1Q16799 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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RTN1Q16799 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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RTN1Q16799 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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RTN1Q16799 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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RTN1Q16799 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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RTN1Q16799 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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RTN1Q16799 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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RTN1Q16799 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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RTN1Q16799 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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RTN1Q16799 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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RTN1Q16799 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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RTN1Q16799 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTN1Q16799 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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