Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKN1Q16512 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PKN1Q16512 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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