Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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CCDC6Q16204 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
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CCDC6Q16204 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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