Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
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