Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CLN3Q13286 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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