Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD8P13378 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HOXD8P13378 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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