Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HIF1AQ16665 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HIF1AQ16665 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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