Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLN3Q13286 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CLN3Q13286 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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