Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
NR5A1Q13285 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NR5A1Q13285 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms