Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ERVV-2B6SEH9 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.1 ms