Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SH3BP1Q9Y3L3 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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