Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FAM53CQ9NYF3 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FAM53CQ9NYF3 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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