Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SMG9Q9H0W8 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMG9Q9H0W8 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMG9Q9H0W8 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMG9Q9H0W8 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMG9Q9H0W8 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMG9Q9H0W8 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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