Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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FOXD1Q16676 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXD1Q16676 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD1Q16676 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXD1Q16676 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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FOXD1Q16676 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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FOXD1Q16676 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXD1Q16676 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXD1Q16676 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD1Q16676 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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