Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SMN1Q16637 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMN1Q16637 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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