Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GRIK4Q16099 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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GRIK4Q16099 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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GRIK4Q16099 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
GRIK4Q16099 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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