Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CAPRIN1Q14444 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CAPRIN1Q14444 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
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